Dragon Warrior III se establece durante muchos años antes de que el original Dragon Warrior en un mundo separado de los dos primeros juegos. Un demonio malvado, Baramos, amenaza con destruir el mundo. La historia gira en torno al héroe, hijo o hija (el jugador puede elegir ser hombre o mujer, con pocos cambios en la jugabilidad) del legendario y fallecido recientemente Ortega. En su cumpleaños décimo sexto, el héroe es convocado al castillo y es dado por el Rey de Aliahan el reto de seguir los pasos de su padre para tratar de librar al mundo de los Baramos, gran enemigo del mal. El héroe entonces es capaz de contratar a tres compañeros de viaje para luchar con Baramos.