A Ressha de Ikou MD es un juego de simulación ferroviaria en tiempo real y parte de la serie A-Train de Artdink. Según los primeros dos juegos de la serie, en cada escenario el jugador debe usar los recursos disponibles para construir un ferrocarril que conecte desde un extremo del mapa al otro. Durante el día, se puede controlar el "A-Train" titular, mediante el cual el jugador puede construir pistas y estaciones. Durante la noche, los horarios de los trenes pueden ser modificados. A medida que el jugador construye, el desarrollo surgirá alrededor de las pistas y estaciones, generando ingresos por los cuales se pueden construir más pistas y estaciones.
El juego ofrece un total de cinco escenarios diferentes de dificultad creciente, que van desde un escenario de práctica para principiantes hasta escenarios muy difíciles para jugadores experimentados. También hay tres configuraciones de velocidad de juego diferentes disponibles.